Illumina公司推出的MiSeq是一臺在單個(gè)儀器上整合了擴(kuò)增、測序和數(shù)據(jù)分析的新款測序儀，每次運(yùn)行能產(chǎn)生超過1Gb的數(shù)據(jù)，且占地面積僅為2平方英尺。MiSeq的流程和準(zhǔn)確性，讓它成為快速且經(jīng)濟(jì)的遺傳分析的理想平臺，適合廣泛的應(yīng)用。同時(shí)Illumina已被FDA大量采購并即將通過FDA認(rèn)證，12年10月，MiSeq系統(tǒng)的測序通量已升級至8G左右。升級通過兩個(gè)方面完成，一個(gè)是cluster密度的增大，升級后cluster密度增加至15-17million，而pair-end讀取的reads數(shù)目將會(huì)增加至30-34million；另一方面是通過測序讀長而提升通量，測序讀長達(dá)到2*300bp，同時(shí)測序速度也有所提升。目前，Broad研究院已經(jīng)利用現(xiàn)有試劑實(shí)現(xiàn)了單端測序300bp讀長，Illumina目前內(nèi)部測序更是完成了2*400bp的pair-end測序。而這些，都是保證在高質(zhì)量數(shù)據(jù)結(jié)果的前提下完成的。

MiSeq性能參數(shù)

Illumina MiSeq測序時(shí)間和數(shù)據(jù)量

Illumina MiSeq讀取量比對

工作流程

illumina二代測序儀 MiSeq四大特性

1、較短的實(shí)驗(yàn)周期：從樣品制備開始需要8小時(shí)即可得到超過100M的高質(zhì)量測序結(jié)果。

2、便捷的樣品制備流程：需50ngDNA模板，2小時(shí)的自動(dòng)化操作就可以完成全部樣品制備工作。

3、測序原理：MiSeq繼續(xù)GA和HiSeq平臺的邊合成邊測序的化學(xué)原理。

4、完整的整合功能：MiSeq可以獨(dú)立完成簇生成，雙向測序及數(shù)據(jù)分析工作，讓經(jīng)費(fèi)和實(shí)驗(yàn)室空間不再成為NGS研究的障礙。

illumina二代測序儀 MiSeq應(yīng)用范圍

1、轉(zhuǎn)錄組測序

派森諾MiSeq測序平臺是基因組已測序物種的轉(zhuǎn)錄組分析平臺。公司技術(shù)團(tuán)隊(duì)目前已完成了包括斑馬魚在內(nèi)的多種植物、動(dòng)物的轉(zhuǎn)錄組測序及分析。

2、宏基因組16S rDNA單V區(qū)測序

對16s rDNA的單V區(qū)(V3\V4)進(jìn)行高通量測序，鑒定細(xì)菌群和古生菌群。派森諾的技術(shù)團(tuán)隊(duì)使用Illumina MiSeq測序16S rDNA V4區(qū)并結(jié)合Roche 454 FLX+測序16S rDNA V1~V3區(qū)成功的對雞的腸道環(huán)境細(xì)菌進(jìn)行了鑒定。

3、Small RNA測序

1*35bp的讀長配合了小RNA的測序長度，速度快，靈敏度高。派森諾的技術(shù)團(tuán)隊(duì)目前已完成了鵝的小RNA測序和多種中草藥的小RNA測序。

4、重測序：包括全基因組重測序、簡化基因組測序、外顯子測序。

Illumina MiSeq非常適用于對微生物基因組的重測序，每次運(yùn)行即可完成一個(gè)微生物基因組測序。2011年12月27日，派森諾的技術(shù)團(tuán)隊(duì)利用MiSeq一次運(yùn)行同時(shí)完成了乳酸菌（Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus casei P8）的重測序，基因組覆蓋深度為分別為404倍和213倍，比對至參考序列，基因組實(shí)現(xiàn)全覆蓋，同時(shí)檢測到了多種結(jié)構(gòu)變異，包括插入、缺失和SNP位點(diǎn)，并且檢測到了全部質(zhì)粒。

數(shù)據(jù)展示

* 以上產(chǎn)品介紹及數(shù)據(jù)來源于Illumina，僅供參考，以Illumina為準(zhǔn)。